Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRR4Q16378 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms