Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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