Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
USF2Q15853 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
USF2Q15853 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
USF2Q15853 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USF2Q15853 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
USF2Q15853 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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