Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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VAMP3Q15836 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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VAMP3Q15836 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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VAMP3Q15836 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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VAMP3Q15836 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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VAMP3Q15836 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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VAMP3Q15836 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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