Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP4Q15650 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms