Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms