Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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