Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMC2Q13753 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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