Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IKZF1Q13422 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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