Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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