Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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CALCOCO2Q13137 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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CALCOCO2Q13137 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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