Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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