Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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