Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
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