Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms