Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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