Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFEMP1Q12805 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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