Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms