Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD47Q08722 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms