Protein–RNA interactions for Protein: Q08116

RGS1, Regulator of G-protein signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS1Q08116 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RGS1Q08116 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms