Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CD164Q04900 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CD164Q04900 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CD164Q04900 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CD164Q04900 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CD164Q04900 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CD164Q04900 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms