Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAE1P78406 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAE1P78406 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAE1P78406 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAE1P78406 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAE1P78406 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms