Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIP4K2BP78356 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2BP78356 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms