Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms