Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB25P57735 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB25P57735 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB25P57735 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms