Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms