Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms