Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms