Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms