Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A1P52655 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms