Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms