Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF6P49848 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF6P49848 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TAF6P49848 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TAF6P49848 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TAF6P49848 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms