Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCT3P49368 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms