Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms