Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA8P48165 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA8P48165 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA8P48165 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA8P48165 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA8P48165 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms