Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSG1P42857 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSG1P42857 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSG1P42857 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms