Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP6P35125 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP6P35125 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP6P35125 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP6P35125 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP6P35125 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP6P35125 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP6P35125 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP6P35125 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP6P35125 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP6P35125 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP6P35125 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP6P35125 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP6P35125 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
USP6P35125 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP6P35125 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms