Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA5P31644 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms