Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms