Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PLNP26678 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PLNP26678 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PLNP26678 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PLNP26678 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PLNP26678 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PLNP26678 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PLNP26678 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PLNP26678 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PLNP26678 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PLNP26678 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PLNP26678 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PLNP26678 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PLNP26678 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PLNP26678 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PLNP26678 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PLNP26678 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms