Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGS1P23219 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms