Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms