Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms