Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms