Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms