Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB4P16144 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms