Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG2P13727 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms