Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms