Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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UBL4AP11441 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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UBL4AP11441 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBL4AP11441 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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