Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms